Dos equipos han salido indemnes de sus enfrentamientos ante el Villarreal en Primera División pero, evidentemente, apenas se les considera en el cómputo porque únicamente ha coincidido en una temporada con el Submarino. El Cádiz y el Extremadura son los conjuntos que no ha salido derrotados ante los amarillos.
En la temporada 1998/99, en la que el Villarreal debutaba en Primera División, el Extremadura sacó un empate en la jornada 19ª en El Madrigal (1-1), mientras que en la 38ª la igualada fue a dos goles en Almendralejo. Ante el Cádiz, la pasada campaña, ambos partidos finalizaron en tablas: 1-1 en Carranza y 1-1 en El Madrigal.
