El proyecto realizado por Santiago Calatrava es el principal foco de polémica. El genial arquitecto valenciano ideó una original solución para hacer de todo el recinto una sola unidad: unir con una cubierta todo el complejo olímpico. A día de hoy esta iniciativa es el principal motivo de controversia en Atenas. El retraso ocasionado por este embellecimiento en todas las obras ha suscitado fuertes críticas, aunque, por el momento, el proyecto se mantiene en pie. Son muchos quienes no quieren ni oír el nombre de Calatrava estos días en la capital griega, pero su ´cúpula´ también cuenta con defensores. "La cubierta debe hacerse, pues dará mucho ´glamour´ a los Juegos Olímpicos", defiende Ioannis Troupis, una estrella de la televisión griega.

El coste del proyecto creado por Santiago Calatrava asciende a 150 millones de euros.