Villarreal y Valencia se han enfrentado en dos ocasiones en la Copa del Rey, con el balance de un pase de ronda para cada equipo. El primer cruce entre ambos se produjo en la temporada 86/87, en primera eliminatoria, con los amarillos en Tercera y los ´che´ en Segunda A, a partido único en El Madrigal. Tras el 1-1 en los 90 minutos se llegó a la prórroga, que concluyó con 2-2. El Submarino se clasificó en la tanda de penaltis.
En la campaña 92/93 ambos equipos se volvieron a ver las caras en los cuartos de final, esta vez a doble partido y con triunfo valencianista (1-2 en El Madrigal y 6-0 en Mestalla).
